不管是串联质谱还是时间飞行质谱，没有标准品物质的保留时间和质谱信息的鉴定都是不精确的。没有保留时间（单靠质谱信息或精确分子量）的判断只能是推断，需要进一步用标准品来验证。如果经费有限，建议采购匹配度最高的标准品物质来排查。

代谢组学（Metabonomics/Metabolomics）是20世纪90年代末期发展起来的一门新兴学科，是研究关于生物体被扰动后（如基因的改变或环境变化后）其代谢产物（内源性代谢物质）种类、数量及其变化规律的科学。代谢组学着重研究的是生物整体、器官或组织的内源性代谢物质的代谢途径及其所受内在或者外在因素的影响及随时间变化的规律。代谢组学通过揭示内在和外在因素影响下代谢整体的变化轨迹来反映某种病理生理过程中所发生的一系列生物事件。

一般来说，代谢组学关注的对象是分子量在1000以下的小分子化合物。根据研究的对象和目的不同，科学家将生物体系的代谢产物分析分为4个层次：

• 代谢物靶标分析：某一个或几个特定组分的定性和定量分析，如某一类结构、性质相关的化合物（氨基酸、有机酸、顺二醇类）或者某一代谢途径的所有中间产物或多条代谢途径的标志性组分。
• 代谢物指纹分析：同时对多个代谢物进行分析，不分离鉴定具体单一组分。
• 代谢轮廓分析：限定条件下对生物体内特定组织内的代谢产物的快速定性和半定量分析。
• 代谢组分析：对生物体或体内某一特定组织所包含的所有代谢物的定量分析，并研究该代谢物组在外界干预或病理生理条件下的动态变化规律。

脂质组学是对整体脂质进行系统分析的一门新兴学科,通过比较不同生理状态下脂代谢网络的变化,进而识别代谢调控中关键的脂生物标志物,最终揭示脂质在各种生命活动中的作用机制。电喷雾电离-质谱技术是脂质组学领域中最核心的研究手段,目前已能对各种脂质尤其是磷脂进行高分辨率、高灵敏度、高通量的分析。随着质谱技术的进步,脂质组学在疾病脂质生物标志物的识别、疾病诊断、药物靶点及先导化合物的发现和药物作用机制的研究等方面已展现出广泛的应用前景。

气相色谱-飞行时间质谱仪在20世纪90年代取得了重大技术突破。由于飞行时间质谱理论上无质量限制，扫描速度和离子采集效率非常高，因此迅速应用于生物领域研究。

GC/TOF-MS仪中时间飞行质量分析器结构简单，具有快速的扫描和高效的离子采集等特点，质量范围宽，其采集信息范围远大于传统的GC/MS,甚至达到500张全谱图/s,对于代谢组学生物物质的全谱分析，GC/TOF-MS的应用前景非常广阔。