这主要是由于衍生化反应造成的。当代谢物有多个活泼氢时，会产生三甲基硅烷基（TMS）取代数目不同的衍生产物。如甘氨酸会生成2TMS和3TMS取代的衍生物。即使衍生试剂过量，也很难保证不同TMS取代个数的产物比例会保持一致。因此，通常的做法是将同一个代谢物的所有衍生产物的面积进行加和。我公司自主开发的XploreMET软件会自动完成这一步骤。