目前，市面上和GC串联的质谱有多种，如TOF、Quadrupole、Linear Ion Trap、Orbitrap、Sector MS以及串接质谱如Q-TOF，TQ等等。目前在代谢组学领域应用最广泛的还是GC-TOFMS平台，因为它具有高通量、高灵敏和稳定性好等优势。对于靶向定量代谢组学，则可选择GC-TQMS。